Projekt Muzeum na Skałce jest częścią większego zamierzenia rozbudowy Panteonu Narodowego na Skałce, które niestety w całości okazało się niewykonalne. Specyficzna lokalizacja oraz uwarunkowania konserwatorskie – od archeologicznych, poprzez architektoniczno-funkcjonalne do krajobrazowych, wynikające z ekspozycji w panoramie wschodniego brzegu Wisły oraz sąsiedniego Wawelu spowodowały konieczność zaprojektowania obiektu prawie całkowicie „zamaskowanego”, niewidocznego z zewnątrz. Ponadto, zabytkowe otoczenie, a także konieczność zachowania codziennego i niezakłóconego funkcjonowania zamieszkałego i stale od wieków użytkowanego budynku klasztoru oo. Paulinów na Skałce w Krakowie, spowodowała wybór rozwiązań funkcjonalno-przestrzennych, zapewniających równoległą koegzystencję przestrzeni publicznej, wypełnionej strumieniem mieszkańców, pątników i turystów oraz niezbędnej przestrzeni prywatnej. Specyficzny koloryt lokalny, użyte materiały budowlane, rozwiązania techniczno-budowlane, sposób doświetlenia muzeum podporządkowano idei harmonijnego wpisania projektowanego obiektu w istniejące otoczenie. Zagadnienia ochrony przeciwpożarowej stały się jednym z istotniejszych problemów wymagających rozstrzygnięcia w skali całego założenia, wpływając na przyjętą funkcję i formę obiektu, a także na rozwiązania w lokalnej skali urbanistycznej.
Museum project on the Rock is part of a larger expansion plans of the national Pantheon on the Rock, which unfortunately turned out to be entirely feasible. The specific location and circumstances of a number of conservation – from archaeological, architectural and through – the functional landscape of exposure in the panorama of the eastern bank of the Vistula River and the adjacent Castle made it necessary to design the building almost completely “masked”, which is invisible from the outside. In addition, the historic environment and the need to maintain the smooth functioning of daily life, constantly inhabited for centuries Pauline Monastery on the Rock in Kraków building, has resulted in the choice of solutions to the functional and spatial relations, providing parallel coexistence of public space, filled with stream of pilgrims and tourists as well as private space for residents. The specific local color, building materials, technical solutions incorporated in the museum building were subordinated to illuminate the way of harmonious ideas proposed inclusion of the object in the existing environment. Fire protection issues have become one of the most important problems to be solved in the whole establishment, influencing the function and form adopted an object as well as the solutions in the local urban scale.